Η καταλληλότητα των περιττωμάτων των ζώων για κομποστοποίηση εξαρτάται από το αν το κατοικίδιο ζώο είναι σαρκοφάγο ή χορτοφάγο. Τα περιττώματα των γατών και των σκύλων είναι εντελώς ακατάλληλα και πρέπει να αποφεύγονται. Επειδή είναι αποτέλεσμα επεξεργασίας κρέατος, θα προσελκύσουν αλογόμυγες και

τις προνύμφες τους. Επιπλέον, μπορεί να μολυνθούν με ασθένειες που είναι επικίνδυνες για τα παιδιά και τις έγκυες γυναίκες. Δυστυχώς, δεν μπορούν να καταστραφούν όλοι οι παθογόνοι μικροοργανισμοί στον οικιακό κομποστοποιητή. Τα υλικά στρωμνής καθώς και τα περιττώματα από ζώα που βόσκουν, όπως κουνέλια και χάμστερ, είναι πολύ κατάλληλα για κομποστοποίηση. Καλαμάκια, εφημερίδες ή πριονίδι εμποτισμένα σε έναν θαυμάσιο ενεργοποιητή – ούρα – είναι κατάλληλα για κομποστοποίηση. Τα περιττώματα μπορούν να θεωρηθούν ως καλά επεξεργασμένα φυτικά υλικά που επιταχύνουν την αποσύνθεση του κομπόστ. Τα πριονίδια χρειάζονται πολύ χρόνο για να αποσυντεθούν και, ως εκ τούτου, συχνά παραμένουν αναλλοίωτα στο τελικό προϊόν, αλλά αυτό δεν εμποδίζει τη χρήση τους.