- Οι πιο επικίνδυνες ασθένειες για το μήλο είναι η ψώρα και το ωίδιο.
- Άλλες μυκητολογικές ασθένειες, όπως η μαύρη, η πρώιμη και η όψιμη καστανή σήψη, εμφανίζονται επίσης κατά τη διάρκεια της ανάπτυξης. Κατά την αποθήκευση αναπτύσσονται κυρίως η μπλε (μαλακή), η γκρίζα και η καστανή σήψη.
- Το μήλο προσβάλλεται επίσης από μεγάλο αριθμό εχθρών, οι πιο επικίνδυνοι από τους οποίους είναι το σκουλήκι των καρπών της μηλιάς, ο σκώρος εξόρυξης και τα ακάρεα των καρπών.